Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNH5

Fam172a, Protein FAM172A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam172aQ3TNH5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fam172aQ3TNH5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fam172aQ3TNH5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fam172aQ3TNH5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam172aQ3TNH5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam172aQ3TNH5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam172aQ3TNH5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fam172aQ3TNH5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam172aQ3TNH5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam172aQ3TNH5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam172aQ3TNH5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam172aQ3TNH5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fam172aQ3TNH5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam172aQ3TNH5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam172aQ3TNH5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam172aQ3TNH5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam172aQ3TNH5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fam172aQ3TNH5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms