Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Trappc13Q3TIR1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trappc13Q3TIR1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Trappc13Q3TIR1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trappc13Q3TIR1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms