Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
H2-M3Q31093 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
H2-M3Q31093 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H2-M3Q31093 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2-M3Q31093 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-M3Q31093 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-M3Q31093 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-M3Q31093 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.27■■□□□ 1
H2-M3Q31093 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-M3Q31093 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
H2-M3Q31093 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
H2-M3Q31093 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-M3Q31093 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-M3Q31093 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2-M3Q31093 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
H2-M3Q31093 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
H2-M3Q31093 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2-M3Q31093 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms