Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Specc1lQ2KN98 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Specc1lQ2KN98 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Specc1lQ2KN98 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Specc1lQ2KN98 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Specc1lQ2KN98 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Specc1lQ2KN98 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Specc1lQ2KN98 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Specc1lQ2KN98 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Specc1lQ2KN98 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Specc1lQ2KN98 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Specc1lQ2KN98 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Specc1lQ2KN98 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Specc1lQ2KN98 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Specc1lQ2KN98 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Specc1lQ2KN98 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Specc1lQ2KN98 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Specc1lQ2KN98 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Specc1lQ2KN98 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Specc1lQ2KN98 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Specc1lQ2KN98 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Specc1lQ2KN98 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Specc1lQ2KN98 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Specc1lQ2KN98 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Specc1lQ2KN98 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Specc1lQ2KN98 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Specc1lQ2KN98 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Specc1lQ2KN98 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Specc1lQ2KN98 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Specc1lQ2KN98 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Specc1lQ2KN98 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Specc1lQ2KN98 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Specc1lQ2KN98 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Specc1lQ2KN98 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms