Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Samd11Q1RNF8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Samd11Q1RNF8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Samd11Q1RNF8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Samd11Q1RNF8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms