Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
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Spatc1Q148B6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Spatc1Q148B6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Spatc1Q148B6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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Spatc1Q148B6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spatc1Q148B6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Spatc1Q148B6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Spatc1Q148B6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Spatc1Q148B6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spatc1Q148B6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Spatc1Q148B6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spatc1Q148B6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spatc1Q148B6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spatc1Q148B6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spatc1Q148B6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Spatc1Q148B6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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Spatc1Q148B6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Spatc1Q148B6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spatc1Q148B6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Spatc1Q148B6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Spatc1Q148B6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Spatc1Q148B6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Spatc1Q148B6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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Spatc1Q148B6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Spatc1Q148B6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Spatc1Q148B6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Spatc1Q148B6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spatc1Q148B6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spatc1Q148B6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Spatc1Q148B6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Spatc1Q148B6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Spatc1Q148B6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spatc1Q148B6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spatc1Q148B6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spatc1Q148B6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spatc1Q148B6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Spatc1Q148B6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Spatc1Q148B6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Spatc1Q148B6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spatc1Q148B6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Spatc1Q148B6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Spatc1Q148B6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spatc1Q148B6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spatc1Q148B6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spatc1Q148B6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spatc1Q148B6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spatc1Q148B6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Spatc1Q148B6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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