Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU8

Bpifa6, BPI fold-containing family A, member 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa6Q0VGU8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Bpifa6Q0VGU8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Bpifa6Q0VGU8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Bpifa6Q0VGU8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Bpifa6Q0VGU8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bpifa6Q0VGU8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bpifa6Q0VGU8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bpifa6Q0VGU8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bpifa6Q0VGU8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bpifa6Q0VGU8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Bpifa6Q0VGU8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bpifa6Q0VGU8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bpifa6Q0VGU8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bpifa6Q0VGU8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Bpifa6Q0VGU8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bpifa6Q0VGU8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Bpifa6Q0VGU8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bpifa6Q0VGU8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Bpifa6Q0VGU8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bpifa6Q0VGU8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Bpifa6Q0VGU8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bpifa6Q0VGU8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bpifa6Q0VGU8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bpifa6Q0VGU8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Bpifa6Q0VGU8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bpifa6Q0VGU8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bpifa6Q0VGU8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bpifa6Q0VGU8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Bpifa6Q0VGU8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Bpifa6Q0VGU8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Bpifa6Q0VGU8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Bpifa6Q0VGU8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms