Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col19a1Q0VF58 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col19a1Q0VF58 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Col19a1Q0VF58 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col19a1Q0VF58 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col19a1Q0VF58 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col19a1Q0VF58 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col19a1Q0VF58 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Col19a1Q0VF58 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col19a1Q0VF58 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col19a1Q0VF58 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col19a1Q0VF58 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col19a1Q0VF58 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col19a1Q0VF58 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Col19a1Q0VF58 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col19a1Q0VF58 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col19a1Q0VF58 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Col19a1Q0VF58 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col19a1Q0VF58 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col19a1Q0VF58 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col19a1Q0VF58 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Col19a1Q0VF58 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col19a1Q0VF58 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col19a1Q0VF58 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col19a1Q0VF58 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Col19a1Q0VF58 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Col19a1Q0VF58 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Col19a1Q0VF58 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col19a1Q0VF58 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col19a1Q0VF58 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Col19a1Q0VF58 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col19a1Q0VF58 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col19a1Q0VF58 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col19a1Q0VF58 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col19a1Q0VF58 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms