Protein–RNA interactions for Protein: Q0P521

1700013D24Rik, MCG1037134, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700013D24RikQ0P521 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700013D24RikQ0P521 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700013D24RikQ0P521 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700013D24RikQ0P521 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700013D24RikQ0P521 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700013D24RikQ0P521 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700013D24RikQ0P521 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700013D24RikQ0P521 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
1700013D24RikQ0P521 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
1700013D24RikQ0P521 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
1700013D24RikQ0P521 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
1700013D24RikQ0P521 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
1700013D24RikQ0P521 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
1700013D24RikQ0P521 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
1700013D24RikQ0P521 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
1700013D24RikQ0P521 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
1700013D24RikQ0P521 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
1700013D24RikQ0P521 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700013D24RikQ0P521 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700013D24RikQ0P521 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700013D24RikQ0P521 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700013D24RikQ0P521 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700013D24RikQ0P521 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700013D24RikQ0P521 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700013D24RikQ0P521 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700013D24RikQ0P521 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700013D24RikQ0P521 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700013D24RikQ0P521 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700013D24RikQ0P521 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700013D24RikQ0P521 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700013D24RikQ0P521 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700013D24RikQ0P521 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700013D24RikQ0P521 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700013D24RikQ0P521 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700013D24RikQ0P521 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700013D24RikQ0P521 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
1700013D24RikQ0P521 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700013D24RikQ0P521 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700013D24RikQ0P521 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700013D24RikQ0P521 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700013D24RikQ0P521 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700013D24RikQ0P521 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms