Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Pate4Q09098 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pate4Q09098 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pate4Q09098 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pate4Q09098 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.1 ms