Protein–RNA interactions for Protein: Q08639

Tfdp1, Transcription factor Dp-1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfdp1Q08639 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tfdp1Q08639 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tfdp1Q08639 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tfdp1Q08639 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tfdp1Q08639 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfdp1Q08639 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfdp1Q08639 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfdp1Q08639 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfdp1Q08639 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfdp1Q08639 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tfdp1Q08639 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tfdp1Q08639 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tfdp1Q08639 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tfdp1Q08639 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tfdp1Q08639 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfdp1Q08639 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfdp1Q08639 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfdp1Q08639 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tfdp1Q08639 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tfdp1Q08639 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tfdp1Q08639 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tfdp1Q08639 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tfdp1Q08639 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tfdp1Q08639 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Tfdp1Q08639 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tfdp1Q08639 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tfdp1Q08639 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tfdp1Q08639 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tfdp1Q08639 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tfdp1Q08639 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tfdp1Q08639 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tfdp1Q08639 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms