Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnma1Q08460 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnma1Q08460 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnma1Q08460 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnma1Q08460 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnma1Q08460 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnma1Q08460 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnma1Q08460 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnma1Q08460 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnma1Q08460 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnma1Q08460 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnma1Q08460 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnma1Q08460 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnma1Q08460 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnma1Q08460 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnma1Q08460 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnma1Q08460 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnma1Q08460 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnma1Q08460 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnma1Q08460 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnma1Q08460 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnma1Q08460 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kcnma1Q08460 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kcnma1Q08460 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kcnma1Q08460 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcnma1Q08460 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcnma1Q08460 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcnma1Q08460 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.8 ms