Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Prrx2Q06348 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prrx2Q06348 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Prrx2Q06348 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prrx2Q06348 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms