Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sdr16c6Q05A13 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sdr16c6Q05A13 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sdr16c6Q05A13 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sdr16c6Q05A13 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms