Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ddr1Q03146 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ddr1Q03146 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ddr1Q03146 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.7 ms