Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HmgcrQ01237 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HmgcrQ01237 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HmgcrQ01237 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HmgcrQ01237 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HmgcrQ01237 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HmgcrQ01237 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HmgcrQ01237 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HmgcrQ01237 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HmgcrQ01237 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HmgcrQ01237 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HmgcrQ01237 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HmgcrQ01237 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HmgcrQ01237 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HmgcrQ01237 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HmgcrQ01237 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HmgcrQ01237 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
HmgcrQ01237 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HmgcrQ01237 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HmgcrQ01237 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HmgcrQ01237 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HmgcrQ01237 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HmgcrQ01237 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HmgcrQ01237 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HmgcrQ01237 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HmgcrQ01237 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HmgcrQ01237 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HmgcrQ01237 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HmgcrQ01237 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HmgcrQ01237 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HmgcrQ01237 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HmgcrQ01237 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HmgcrQ01237 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HmgcrQ01237 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HmgcrQ01237 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HmgcrQ01237 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HmgcrQ01237 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HmgcrQ01237 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HmgcrQ01237 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HmgcrQ01237 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HmgcrQ01237 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HmgcrQ01237 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HmgcrQ01237 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HmgcrQ01237 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HmgcrQ01237 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HmgcrQ01237 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HmgcrQ01237 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HmgcrQ01237 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HmgcrQ01237 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HmgcrQ01237 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HmgcrQ01237 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HmgcrQ01237 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HmgcrQ01237 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HmgcrQ01237 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HmgcrQ01237 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HmgcrQ01237 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms