Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rbbp6P97868 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rbbp6P97868 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rbbp6P97868 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rbbp6P97868 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rbbp6P97868 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rbbp6P97868 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rbbp6P97868 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rbbp6P97868 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Rbbp6P97868 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rbbp6P97868 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rbbp6P97868 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rbbp6P97868 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Rbbp6P97868 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rbbp6P97868 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rbbp6P97868 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Rbbp6P97868 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rbbp6P97868 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rbbp6P97868 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rbbp6P97868 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rbbp6P97868 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rbbp6P97868 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rbbp6P97868 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Rbbp6P97868 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rbbp6P97868 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rbbp6P97868 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rbbp6P97868 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rbbp6P97868 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rbbp6P97868 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Rbbp6P97868 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rbbp6P97868 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rbbp6P97868 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rbbp6P97868 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rbbp6P97868 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rbbp6P97868 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rbbp6P97868 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rbbp6P97868 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rbbp6P97868 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rbbp6P97868 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rbbp6P97868 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rbbp6P97868 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rbbp6P97868 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rbbp6P97868 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rbbp6P97868 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rbbp6P97868 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rbbp6P97868 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rbbp6P97868 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rbbp6P97868 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rbbp6P97868 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rbbp6P97868 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rbbp6P97868 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rbbp6P97868 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rbbp6P97868 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rbbp6P97868 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Rbbp6P97868 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rbbp6P97868 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rbbp6P97868 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rbbp6P97868 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rbbp6P97868 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rbbp6P97868 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rbbp6P97868 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rbbp6P97868 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rbbp6P97868 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rbbp6P97868 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rbbp6P97868 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rbbp6P97868 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rbbp6P97868 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rbbp6P97868 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Rbbp6P97868 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rbbp6P97868 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rbbp6P97868 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms