Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IhhP97812 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IhhP97812 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IhhP97812 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IhhP97812 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IhhP97812 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IhhP97812 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IhhP97812 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IhhP97812 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IhhP97812 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IhhP97812 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IhhP97812 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IhhP97812 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IhhP97812 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IhhP97812 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IhhP97812 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IhhP97812 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IhhP97812 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
IhhP97812 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IhhP97812 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IhhP97812 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IhhP97812 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IhhP97812 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IhhP97812 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IhhP97812 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IhhP97812 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IhhP97812 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IhhP97812 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IhhP97812 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IhhP97812 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IhhP97812 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IhhP97812 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IhhP97812 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IhhP97812 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IhhP97812 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
IhhP97812 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IhhP97812 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IhhP97812 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IhhP97812 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IhhP97812 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IhhP97812 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IhhP97812 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IhhP97812 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IhhP97812 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IhhP97812 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IhhP97812 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IhhP97812 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IhhP97812 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IhhP97812 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IhhP97812 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IhhP97812 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IhhP97812 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IhhP97812 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
IhhP97812 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IhhP97812 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IhhP97812 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IhhP97812 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IhhP97812 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IhhP97812 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IhhP97812 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IhhP97812 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IhhP97812 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IhhP97812 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IhhP97812 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IhhP97812 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IhhP97812 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IhhP97812 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IhhP97812 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IhhP97812 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IhhP97812 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IhhP97812 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IhhP97812 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IhhP97812 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IhhP97812 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IhhP97812 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IhhP97812 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
IhhP97812 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
IhhP97812 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IhhP97812 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IhhP97812 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IhhP97812 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IhhP97812 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IhhP97812 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
IhhP97812 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IhhP97812 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IhhP97812 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IhhP97812 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IhhP97812 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IhhP97812 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IhhP97812 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IhhP97812 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IhhP97812 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IhhP97812 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IhhP97812 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IhhP97812 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IhhP97812 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IhhP97812 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IhhP97812 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IhhP97812 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IhhP97812 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms