Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cry1P97784 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cry1P97784 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cry1P97784 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cry1P97784 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cry1P97784 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cry1P97784 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cry1P97784 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cry1P97784 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cry1P97784 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cry1P97784 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cry1P97784 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cry1P97784 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cry1P97784 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cry1P97784 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cry1P97784 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cry1P97784 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cry1P97784 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cry1P97784 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cry1P97784 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cry1P97784 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cry1P97784 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cry1P97784 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cry1P97784 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cry1P97784 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cry1P97784 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cry1P97784 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cry1P97784 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cry1P97784 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cry1P97784 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cry1P97784 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cry1P97784 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cry1P97784 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cry1P97784 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cry1P97784 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cry1P97784 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cry1P97784 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cry1P97784 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cry1P97784 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cry1P97784 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms