Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Meis3P97368 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Meis3P97368 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Meis3P97368 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Meis3P97368 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Meis3P97368 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Meis3P97368 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Meis3P97368 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Meis3P97368 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Meis3P97368 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Meis3P97368 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Meis3P97368 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Meis3P97368 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Meis3P97368 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Meis3P97368 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Meis3P97368 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Meis3P97368 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms