Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkp1P97350 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pkp1P97350 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pkp1P97350 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pkp1P97350 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pkp1P97350 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pkp1P97350 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pkp1P97350 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pkp1P97350 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pkp1P97350 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pkp1P97350 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pkp1P97350 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pkp1P97350 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pkp1P97350 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pkp1P97350 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pkp1P97350 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pkp1P97350 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Pkp1P97350 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pkp1P97350 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pkp1P97350 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pkp1P97350 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pkp1P97350 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pkp1P97350 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pkp1P97350 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pkp1P97350 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pkp1P97350 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pkp1P97350 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pkp1P97350 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pkp1P97350 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pkp1P97350 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pkp1P97350 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pkp1P97350 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pkp1P97350 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pkp1P97350 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pkp1P97350 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pkp1P97350 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pkp1P97350 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pkp1P97350 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pkp1P97350 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pkp1P97350 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pkp1P97350 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Pkp1P97350 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pkp1P97350 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pkp1P97350 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pkp1P97350 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pkp1P97350 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pkp1P97350 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pkp1P97350 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pkp1P97350 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pkp1P97350 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Pkp1P97350 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pkp1P97350 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pkp1P97350 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pkp1P97350 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pkp1P97350 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pkp1P97350 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pkp1P97350 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pkp1P97350 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkp1P97350 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkp1P97350 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkp1P97350 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.7 ms