Protein–RNA interactions for Protein: P84084

Arf5, ADP-ribosylation factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf5P84084 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arf5P84084 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arf5P84084 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arf5P84084 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Arf5P84084 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Arf5P84084 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Arf5P84084 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arf5P84084 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arf5P84084 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arf5P84084 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arf5P84084 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arf5P84084 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arf5P84084 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arf5P84084 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arf5P84084 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arf5P84084 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arf5P84084 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arf5P84084 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arf5P84084 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arf5P84084 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arf5P84084 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arf5P84084 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arf5P84084 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arf5P84084 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arf5P84084 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arf5P84084 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arf5P84084 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arf5P84084 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arf5P84084 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arf5P84084 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arf5P84084 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arf5P84084 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arf5P84084 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Arf5P84084 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arf5P84084 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arf5P84084 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arf5P84084 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arf5P84084 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arf5P84084 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arf5P84084 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arf5P84084 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Arf5P84084 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arf5P84084 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arf5P84084 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arf5P84084 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arf5P84084 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arf5P84084 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Arf5P84084 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arf5P84084 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Arf5P84084 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arf5P84084 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arf5P84084 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Arf5P84084 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arf5P84084 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arf5P84084 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arf5P84084 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arf5P84084 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arf5P84084 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arf5P84084 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arf5P84084 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arf5P84084 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arf5P84084 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arf5P84084 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arf5P84084 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arf5P84084 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arf5P84084 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Arf5P84084 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arf5P84084 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arf5P84084 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arf5P84084 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arf5P84084 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms