Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ElocP83940 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ElocP83940 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ElocP83940 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ElocP83940 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ElocP83940 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ElocP83940 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ElocP83940 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ElocP83940 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ElocP83940 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ElocP83940 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ElocP83940 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ElocP83940 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ElocP83940 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ElocP83940 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ElocP83940 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ElocP83940 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ElocP83940 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ElocP83940 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ElocP83940 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ElocP83940 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ElocP83940 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ElocP83940 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ElocP83940 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ElocP83940 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ElocP83940 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ElocP83940 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ElocP83940 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ElocP83940 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ElocP83940 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ElocP83940 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ElocP83940 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ElocP83940 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ElocP83940 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ElocP83940 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ElocP83940 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ElocP83940 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ElocP83940 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ElocP83940 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ElocP83940 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ElocP83940 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ElocP83940 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ElocP83940 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ElocP83940 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ElocP83940 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ElocP83940 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ElocP83940 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ElocP83940 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ElocP83940 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ElocP83940 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ElocP83940 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ElocP83940 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ElocP83940 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ElocP83940 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ElocP83940 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ElocP83940 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ElocP83940 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ElocP83940 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ElocP83940 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ElocP83940 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ElocP83940 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ElocP83940 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ElocP83940 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ElocP83940 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ElocP83940 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ElocP83940 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ElocP83940 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ElocP83940 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ElocP83940 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ElocP83940 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ElocP83940 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ElocP83940 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ElocP83940 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ElocP83940 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ElocP83940 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ElocP83940 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ElocP83940 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ElocP83940 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ElocP83940 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ElocP83940 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ElocP83940 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ElocP83940 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ElocP83940 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ElocP83940 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ElocP83940 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ElocP83940 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ElocP83940 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ElocP83940 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ElocP83940 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ElocP83940 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ElocP83940 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ElocP83940 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ElocP83940 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ElocP83940 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ElocP83940 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ElocP83940 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ElocP83940 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ElocP83940 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ElocP83940 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ElocP83940 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.7 ms