Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cbx1P83917 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cbx1P83917 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cbx1P83917 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Cbx1P83917 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx1P83917 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cbx1P83917 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cbx1P83917 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cbx1P83917 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cbx1P83917 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cbx1P83917 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cbx1P83917 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cbx1P83917 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cbx1P83917 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cbx1P83917 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cbx1P83917 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cbx1P83917 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cbx1P83917 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx1P83917 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx1P83917 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx1P83917 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx1P83917 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cbx1P83917 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cbx1P83917 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cbx1P83917 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cbx1P83917 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cbx1P83917 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cbx1P83917 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cbx1P83917 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cbx1P83917 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms