Protein–RNA interactions for Protein: P70275

Sema3e, Semaphorin-3E, mousemouse

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3eP70275 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sema3eP70275 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sema3eP70275 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sema3eP70275 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sema3eP70275 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sema3eP70275 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sema3eP70275 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sema3eP70275 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Sema3eP70275 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sema3eP70275 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sema3eP70275 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sema3eP70275 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sema3eP70275 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sema3eP70275 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Sema3eP70275 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sema3eP70275 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sema3eP70275 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sema3eP70275 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sema3eP70275 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sema3eP70275 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sema3eP70275 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sema3eP70275 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sema3eP70275 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sema3eP70275 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sema3eP70275 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sema3eP70275 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sema3eP70275 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sema3eP70275 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sema3eP70275 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sema3eP70275 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sema3eP70275 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms