Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SnrpfP62307 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SnrpfP62307 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SnrpfP62307 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SnrpfP62307 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SnrpfP62307 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SnrpfP62307 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SnrpfP62307 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnrpfP62307 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnrpfP62307 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnrpfP62307 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnrpfP62307 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SnrpfP62307 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SnrpfP62307 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SnrpfP62307 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnrpfP62307 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnrpfP62307 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnrpfP62307 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnrpfP62307 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnrpfP62307 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnrpfP62307 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SnrpfP62307 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SnrpfP62307 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SnrpfP62307 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SnrpfP62307 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SnrpfP62307 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SnrpfP62307 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms