Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps29P62274 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps29P62274 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps29P62274 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps29P62274 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps29P62274 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rps29P62274 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Rps29P62274 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps29P62274 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps29P62274 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rps29P62274 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Rps29P62274 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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