Protein–RNA interactions for Protein: P61967

Ap1s1, AP-1 complex subunit sigma-1A, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s1P61967 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap1s1P61967 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap1s1P61967 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ap1s1P61967 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ap1s1P61967 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap1s1P61967 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap1s1P61967 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap1s1P61967 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap1s1P61967 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ap1s1P61967 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap1s1P61967 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap1s1P61967 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ap1s1P61967 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap1s1P61967 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap1s1P61967 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap1s1P61967 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap1s1P61967 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap1s1P61967 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap1s1P61967 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap1s1P61967 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ap1s1P61967 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap1s1P61967 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap1s1P61967 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ap1s1P61967 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ap1s1P61967 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ap1s1P61967 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ap1s1P61967 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ap1s1P61967 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms