Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC33.77■■■■□ 3
Depdc5P61460 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Depdc5P61460 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Depdc5P61460 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Depdc5P61460 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Depdc5P61460 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Depdc5P61460 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Depdc5P61460 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Depdc5P61460 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Depdc5P61460 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Depdc5P61460 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Depdc5P61460 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Depdc5P61460 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Depdc5P61460 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Depdc5P61460 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Depdc5P61460 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Depdc5P61460 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Depdc5P61460 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Depdc5P61460 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Depdc5P61460 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Depdc5P61460 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Depdc5P61460 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Depdc5P61460 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Depdc5P61460 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Depdc5P61460 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Depdc5P61460 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Depdc5P61460 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Depdc5P61460 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Depdc5P61460 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Depdc5P61460 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Depdc5P61460 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Depdc5P61460 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Depdc5P61460 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Depdc5P61460 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Depdc5P61460 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Depdc5P61460 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Depdc5P61460 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Depdc5P61460 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Depdc5P61460 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Depdc5P61460 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Depdc5P61460 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Depdc5P61460 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Depdc5P61460 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Depdc5P61460 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Depdc5P61460 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Depdc5P61460 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Depdc5P61460 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Depdc5P61460 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Depdc5P61460 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Depdc5P61460 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Depdc5P61460 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Depdc5P61460 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Depdc5P61460 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Depdc5P61460 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Depdc5P61460 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Depdc5P61460 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Depdc5P61460 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Depdc5P61460 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Depdc5P61460 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Depdc5P61460 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Depdc5P61460 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Depdc5P61460 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Depdc5P61460 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Depdc5P61460 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Depdc5P61460 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Depdc5P61460 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Depdc5P61460 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Depdc5P61460 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Depdc5P61460 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Depdc5P61460 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Depdc5P61460 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Depdc5P61460 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Depdc5P61460 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Depdc5P61460 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Depdc5P61460 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Depdc5P61460 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Depdc5P61460 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Depdc5P61460 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Depdc5P61460 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
Depdc5P61460 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Depdc5P61460 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Depdc5P61460 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Depdc5P61460 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Depdc5P61460 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Depdc5P61460 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Depdc5P61460 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Depdc5P61460 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Depdc5P61460 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Depdc5P61460 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Depdc5P61460 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Depdc5P61460 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Depdc5P61460 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Depdc5P61460 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Depdc5P61460 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Depdc5P61460 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Depdc5P61460 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Depdc5P61460 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Depdc5P61460 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Depdc5P61460 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
Depdc5P61460 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms