Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CirbpP60824 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CirbpP60824 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CirbpP60824 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CirbpP60824 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CirbpP60824 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CirbpP60824 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CirbpP60824 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CirbpP60824 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CirbpP60824 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CirbpP60824 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.3 ms