Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pcif1P59114 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pcif1P59114 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pcif1P59114 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcif1P59114 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcif1P59114 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pcif1P59114 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcif1P59114 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcif1P59114 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcif1P59114 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcif1P59114 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pcif1P59114 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcif1P59114 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcif1P59114 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pcif1P59114 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcif1P59114 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcif1P59114 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcif1P59114 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcif1P59114 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcif1P59114 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcif1P59114 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcif1P59114 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcif1P59114 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcif1P59114 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcif1P59114 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcif1P59114 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcif1P59114 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcif1P59114 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcif1P59114 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms