Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Csrnp1P59054 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Csrnp1P59054 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Csrnp1P59054 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Csrnp1P59054 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Csrnp1P59054 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Csrnp1P59054 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Csrnp1P59054 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Csrnp1P59054 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Csrnp1P59054 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Csrnp1P59054 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Csrnp1P59054 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Csrnp1P59054 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Csrnp1P59054 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Csrnp1P59054 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Csrnp1P59054 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Csrnp1P59054 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Csrnp1P59054 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Csrnp1P59054 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Csrnp1P59054 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Csrnp1P59054 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Csrnp1P59054 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Csrnp1P59054 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Csrnp1P59054 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Csrnp1P59054 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Csrnp1P59054 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Csrnp1P59054 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Csrnp1P59054 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Csrnp1P59054 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Csrnp1P59054 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Csrnp1P59054 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Csrnp1P59054 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Csrnp1P59054 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Csrnp1P59054 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Csrnp1P59054 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Csrnp1P59054 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Csrnp1P59054 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 206.3 ms