Protein–RNA interactions for Protein: P56203

Ctsw, Cathepsin W, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtswP56203 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtswP56203 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtswP56203 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtswP56203 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtswP56203 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtswP56203 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtswP56203 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtswP56203 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtswP56203 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtswP56203 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtswP56203 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtswP56203 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtswP56203 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtswP56203 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CtswP56203 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtswP56203 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtswP56203 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtswP56203 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtswP56203 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtswP56203 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtswP56203 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtswP56203 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtswP56203 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CtswP56203 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtswP56203 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtswP56203 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtswP56203 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtswP56203 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtswP56203 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtswP56203 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtswP56203 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtswP56203 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtswP56203 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtswP56203 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtswP56203 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtswP56203 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtswP56203 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtswP56203 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtswP56203 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtswP56203 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtswP56203 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtswP56203 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtswP56203 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtswP56203 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtswP56203 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtswP56203 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CtswP56203 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtswP56203 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtswP56203 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtswP56203 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtswP56203 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CtswP56203 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtswP56203 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CtswP56203 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtswP56203 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtswP56203 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtswP56203 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CtswP56203 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtswP56203 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtswP56203 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CtswP56203 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtswP56203 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtswP56203 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CtswP56203 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtswP56203 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtswP56203 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtswP56203 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtswP56203 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtswP56203 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CtswP56203 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtswP56203 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CtswP56203 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CtswP56203 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtswP56203 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtswP56203 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CtswP56203 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtswP56203 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtswP56203 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtswP56203 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtswP56203 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtswP56203 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtswP56203 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtswP56203 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CtswP56203 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtswP56203 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtswP56203 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtswP56203 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtswP56203 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtswP56203 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CtswP56203 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtswP56203 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtswP56203 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtswP56203 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtswP56203 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtswP56203 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtswP56203 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtswP56203 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtswP56203 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtswP56203 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CtswP56203 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.6 ms