Protein–RNA interactions for Protein: P55105

Bmp8b, Bone morphogenetic protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp8bP55105 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Bmp8bP55105 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Bmp8bP55105 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bmp8bP55105 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bmp8bP55105 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bmp8bP55105 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bmp8bP55105 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bmp8bP55105 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bmp8bP55105 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bmp8bP55105 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bmp8bP55105 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bmp8bP55105 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bmp8bP55105 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bmp8bP55105 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bmp8bP55105 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bmp8bP55105 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bmp8bP55105 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bmp8bP55105 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bmp8bP55105 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bmp8bP55105 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bmp8bP55105 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bmp8bP55105 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Bmp8bP55105 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bmp8bP55105 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bmp8bP55105 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bmp8bP55105 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bmp8bP55105 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bmp8bP55105 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms