Protein–RNA interactions for Protein: P50396

Gdi1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdi1P50396 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdi1P50396 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdi1P50396 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gdi1P50396 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gdi1P50396 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdi1P50396 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdi1P50396 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdi1P50396 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdi1P50396 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdi1P50396 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gdi1P50396 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdi1P50396 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdi1P50396 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gdi1P50396 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdi1P50396 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdi1P50396 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdi1P50396 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdi1P50396 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdi1P50396 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdi1P50396 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gdi1P50396 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdi1P50396 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdi1P50396 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdi1P50396 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdi1P50396 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gdi1P50396 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdi1P50396 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdi1P50396 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdi1P50396 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gdi1P50396 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gdi1P50396 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gdi1P50396 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms