Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brca1P48754 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brca1P48754 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brca1P48754 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Brca1P48754 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Brca1P48754 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Brca1P48754 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Brca1P48754 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brca1P48754 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Brca1P48754 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brca1P48754 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brca1P48754 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brca1P48754 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brca1P48754 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Brca1P48754 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brca1P48754 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brca1P48754 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brca1P48754 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brca1P48754 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Brca1P48754 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brca1P48754 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brca1P48754 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brca1P48754 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brca1P48754 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Brca1P48754 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Brca1P48754 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Brca1P48754 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Brca1P48754 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Brca1P48754 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Brca1P48754 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Brca1P48754 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brca1P48754 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brca1P48754 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Brca1P48754 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Brca1P48754 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brca1P48754 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brca1P48754 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Brca1P48754 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Brca1P48754 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brca1P48754 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brca1P48754 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Brca1P48754 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Brca1P48754 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brca1P48754 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brca1P48754 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brca1P48754 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brca1P48754 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brca1P48754 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brca1P48754 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brca1P48754 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Brca1P48754 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Brca1P48754 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Brca1P48754 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brca1P48754 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brca1P48754 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Brca1P48754 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brca1P48754 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brca1P48754 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Brca1P48754 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brca1P48754 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Brca1P48754 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Brca1P48754 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brca1P48754 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brca1P48754 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Brca1P48754 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms