Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Epb41P48193 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Epb41P48193 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Epb41P48193 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Epb41P48193 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Epb41P48193 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Epb41P48193 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Epb41P48193 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Epb41P48193 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Epb41P48193 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Epb41P48193 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Epb41P48193 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Epb41P48193 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Epb41P48193 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Epb41P48193 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Epb41P48193 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Epb41P48193 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Epb41P48193 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Epb41P48193 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Epb41P48193 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Epb41P48193 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Epb41P48193 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Epb41P48193 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Epb41P48193 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Epb41P48193 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms