Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli1P47806 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli1P47806 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli1P47806 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli1P47806 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gli1P47806 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli1P47806 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli1P47806 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gli1P47806 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gli1P47806 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gli1P47806 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gli1P47806 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gli1P47806 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli1P47806 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli1P47806 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli1P47806 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli1P47806 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli1P47806 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli1P47806 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli1P47806 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli1P47806 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gli1P47806 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gli1P47806 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gli1P47806 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gli1P47806 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gli1P47806 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gli1P47806 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gli1P47806 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gli1P47806 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gli1P47806 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gli1P47806 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gli1P47806 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gli1P47806 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gli1P47806 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gli1P47806 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gli1P47806 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gli1P47806 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gli1P47806 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gli1P47806 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gli1P47806 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gli1P47806 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gli1P47806 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gli1P47806 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gli1P47806 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gli1P47806 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gli1P47806 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gli1P47806 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gli1P47806 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gli1P47806 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gli1P47806 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gli1P47806 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gli1P47806 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gli1P47806 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gli1P47806 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gli1P47806 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gli1P47806 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gli1P47806 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms