Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nedd4P46935 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nedd4P46935 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nedd4P46935 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nedd4P46935 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Nedd4P46935 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nedd4P46935 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nedd4P46935 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nedd4P46935 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nedd4P46935 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nedd4P46935 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nedd4P46935 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nedd4P46935 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nedd4P46935 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Nedd4P46935 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Nedd4P46935 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nedd4P46935 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nedd4P46935 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nedd4P46935 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nedd4P46935 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nedd4P46935 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nedd4P46935 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nedd4P46935 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nedd4P46935 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nedd4P46935 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Nedd4P46935 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nedd4P46935 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nedd4P46935 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Nedd4P46935 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nedd4P46935 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Nedd4P46935 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nedd4P46935 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nedd4P46935 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nedd4P46935 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nedd4P46935 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Nedd4P46935 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Nedd4P46935 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nedd4P46935 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nedd4P46935 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nedd4P46935 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Nedd4P46935 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nedd4P46935 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nedd4P46935 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nedd4P46935 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nedd4P46935 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nedd4P46935 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nedd4P46935 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nedd4P46935 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nedd4P46935 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nedd4P46935 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nedd4P46935 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nedd4P46935 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nedd4P46935 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nedd4P46935 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Nedd4P46935 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Nedd4P46935 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Nedd4P46935 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nedd4P46935 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nedd4P46935 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nedd4P46935 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nedd4P46935 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nedd4P46935 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nedd4P46935 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nedd4P46935 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nedd4P46935 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nedd4P46935 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nedd4P46935 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Nedd4P46935 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nedd4P46935 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Nedd4P46935 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nedd4P46935 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nedd4P46935 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nedd4P46935 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Nedd4P46935 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nedd4P46935 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nedd4P46935 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nedd4P46935 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nedd4P46935 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nedd4P46935 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nedd4P46935 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nedd4P46935 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Nedd4P46935 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Nedd4P46935 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nedd4P46935 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nedd4P46935 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nedd4P46935 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nedd4P46935 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nedd4P46935 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nedd4P46935 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nedd4P46935 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Nedd4P46935 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nedd4P46935 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nedd4P46935 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nedd4P46935 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nedd4P46935 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nedd4P46935 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nedd4P46935 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nedd4P46935 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nedd4P46935 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nedd4P46935 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.9 ms