Protein–RNA interactions for Protein: P46737

Brcc3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brcc3P46737 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Brcc3P46737 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Brcc3P46737 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Brcc3P46737 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms