Protein–RNA interactions for Protein: P46718

Pdcd2, Programmed cell death protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd2P46718 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pdcd2P46718 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pdcd2P46718 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcd2P46718 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcd2P46718 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcd2P46718 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcd2P46718 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcd2P46718 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcd2P46718 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pdcd2P46718 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcd2P46718 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcd2P46718 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcd2P46718 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcd2P46718 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcd2P46718 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcd2P46718 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcd2P46718 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcd2P46718 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pdcd2P46718 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcd2P46718 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcd2P46718 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcd2P46718 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcd2P46718 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcd2P46718 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pdcd2P46718 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcd2P46718 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcd2P46718 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.2 ms