Protein–RNA interactions for Protein: P46460

Nsf, Vesicle-fusing ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsfP46460 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NsfP46460 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NsfP46460 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NsfP46460 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NsfP46460 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NsfP46460 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NsfP46460 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NsfP46460 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NsfP46460 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NsfP46460 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NsfP46460 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NsfP46460 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NsfP46460 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NsfP46460 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NsfP46460 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NsfP46460 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NsfP46460 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NsfP46460 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NsfP46460 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NsfP46460 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NsfP46460 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NsfP46460 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NsfP46460 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NsfP46460 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NsfP46460 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NsfP46460 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NsfP46460 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NsfP46460 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NsfP46460 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NsfP46460 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NsfP46460 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NsfP46460 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NsfP46460 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NsfP46460 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NsfP46460 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NsfP46460 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NsfP46460 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NsfP46460 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NsfP46460 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NsfP46460 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NsfP46460 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NsfP46460 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NsfP46460 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NsfP46460 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NsfP46460 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NsfP46460 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NsfP46460 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NsfP46460 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NsfP46460 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NsfP46460 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NsfP46460 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NsfP46460 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NsfP46460 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NsfP46460 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NsfP46460 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NsfP46460 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NsfP46460 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NsfP46460 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NsfP46460 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NsfP46460 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NsfP46460 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NsfP46460 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NsfP46460 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NsfP46460 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NsfP46460 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NsfP46460 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NsfP46460 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NsfP46460 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NsfP46460 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NsfP46460 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NsfP46460 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NsfP46460 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NsfP46460 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NsfP46460 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NsfP46460 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NsfP46460 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NsfP46460 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NsfP46460 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NsfP46460 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NsfP46460 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NsfP46460 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NsfP46460 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NsfP46460 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NsfP46460 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NsfP46460 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NsfP46460 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NsfP46460 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NsfP46460 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NsfP46460 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NsfP46460 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NsfP46460 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NsfP46460 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NsfP46460 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NsfP46460 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NsfP46460 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NsfP46460 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NsfP46460 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NsfP46460 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NsfP46460 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NsfP46460 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114 ms