Protein–RNA interactions for Protein: P43006

Slc1a2, Excitatory amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a2P43006 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc1a2P43006 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Slc1a2P43006 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Slc1a2P43006 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms