Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpl28P41105 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpl28P41105 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl28P41105 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.4 ms