Protein–RNA interactions for Protein: P35486

Pdha1, Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdha1P35486 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pdha1P35486 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pdha1P35486 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pdha1P35486 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pdha1P35486 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pdha1P35486 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pdha1P35486 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms