Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sftpa1P35242 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sftpa1P35242 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sftpa1P35242 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sftpa1P35242 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sftpa1P35242 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sftpa1P35242 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sftpa1P35242 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sftpa1P35242 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sftpa1P35242 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sftpa1P35242 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sftpa1P35242 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sftpa1P35242 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sftpa1P35242 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sftpa1P35242 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sftpa1P35242 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sftpa1P35242 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sftpa1P35242 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sftpa1P35242 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sftpa1P35242 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sftpa1P35242 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sftpa1P35242 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sftpa1P35242 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sftpa1P35242 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sftpa1P35242 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sftpa1P35242 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sftpa1P35242 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sftpa1P35242 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sftpa1P35242 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sftpa1P35242 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sftpa1P35242 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sftpa1P35242 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sftpa1P35242 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sftpa1P35242 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sftpa1P35242 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sftpa1P35242 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sftpa1P35242 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sftpa1P35242 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sftpa1P35242 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sftpa1P35242 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sftpa1P35242 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sftpa1P35242 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sftpa1P35242 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sftpa1P35242 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sftpa1P35242 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sftpa1P35242 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sftpa1P35242 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sftpa1P35242 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sftpa1P35242 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sftpa1P35242 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sftpa1P35242 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sftpa1P35242 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sftpa1P35242 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms