Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxc10P31257 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxc10P31257 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxc10P31257 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxc10P31257 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxc10P31257 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc10P31257 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc10P31257 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxc10P31257 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxc10P31257 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxc10P31257 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxc10P31257 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc10P31257 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc10P31257 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc10P31257 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc10P31257 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxc10P31257 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxc10P31257 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxc10P31257 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxc10P31257 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxc10P31257 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxc10P31257 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxc10P31257 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxc10P31257 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxc10P31257 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hoxc10P31257 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxc10P31257 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxc10P31257 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxc10P31257 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc10P31257 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc10P31257 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc10P31257 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc10P31257 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc10P31257 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxc10P31257 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxc10P31257 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxc10P31257 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxc10P31257 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxc10P31257 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxc10P31257 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxc10P31257 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxc10P31257 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc10P31257 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc10P31257 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc10P31257 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc10P31257 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc10P31257 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxc10P31257 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxc10P31257 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxc10P31257 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxc10P31257 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxc10P31257 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxc10P31257 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxc10P31257 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms