Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tacr1P30548 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Tacr1P30548 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tacr1P30548 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tacr1P30548 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms