Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Kif3aP28741 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Kif3aP28741 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kif3aP28741 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Kif3aP28741 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kif3aP28741 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kif3aP28741 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Kif3aP28741 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kif3aP28741 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kif3aP28741 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kif3aP28741 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kif3aP28741 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kif3aP28741 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kif3aP28741 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kif3aP28741 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kif3aP28741 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kif3aP28741 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kif3aP28741 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kif3aP28741 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kif3aP28741 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kif3aP28741 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kif3aP28741 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kif3aP28741 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms