Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NapbP28663 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NapbP28663 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NapbP28663 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NapbP28663 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NapbP28663 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NapbP28663 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NapbP28663 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NapbP28663 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NapbP28663 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NapbP28663 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NapbP28663 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NapbP28663 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NapbP28663 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NapbP28663 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NapbP28663 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NapbP28663 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NapbP28663 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NapbP28663 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NapbP28663 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NapbP28663 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NapbP28663 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NapbP28663 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NapbP28663 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NapbP28663 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NapbP28663 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NapbP28663 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NapbP28663 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NapbP28663 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NapbP28663 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NapbP28663 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NapbP28663 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NapbP28663 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NapbP28663 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NapbP28663 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NapbP28663 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NapbP28663 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NapbP28663 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NapbP28663 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NapbP28663 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NapbP28663 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NapbP28663 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NapbP28663 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NapbP28663 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NapbP28663 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NapbP28663 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NapbP28663 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NapbP28663 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NapbP28663 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NapbP28663 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
NapbP28663 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NapbP28663 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NapbP28663 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NapbP28663 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NapbP28663 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NapbP28663 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NapbP28663 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NapbP28663 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NapbP28663 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NapbP28663 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NapbP28663 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NapbP28663 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NapbP28663 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NapbP28663 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NapbP28663 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NapbP28663 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NapbP28663 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NapbP28663 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NapbP28663 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NapbP28663 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NapbP28663 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NapbP28663 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NapbP28663 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NapbP28663 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NapbP28663 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NapbP28663 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NapbP28663 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NapbP28663 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NapbP28663 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NapbP28663 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NapbP28663 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NapbP28663 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
NapbP28663 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NapbP28663 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NapbP28663 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NapbP28663 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NapbP28663 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NapbP28663 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NapbP28663 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NapbP28663 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NapbP28663 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NapbP28663 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NapbP28663 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NapbP28663 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NapbP28663 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NapbP28663 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NapbP28663 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NapbP28663 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NapbP28663 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NapbP28663 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms